Уцелевшая часть собрания, включая сохранившиеся голландские зоологические предметы, была временно переведена в дом Демидова, тоже на Стрелке Васильевского острова. Для пополнения пострадавших коллекций были сделаны многочисленные покупки. В том числе в 1752 году с аукциона были приобретены некоторые материалы из второго собрания А. Себы, умершего в 1736 году, К. Б. Юрьев, изучавший дело о покупке, указывал, что всего в счёте-фактуре числится 37 оплаченных экспонатов. Список этих экземпляров по-голландски опубликован у Йозин Дриссен, которая не только приводит названия купленных животных и цены, но и ссылается на картинки из первого тома себовского каталога. В том же деле можно обнаружить «Перевод с фактуры, присланной из Амстердама от материалиста Дитриха Шмидта о купленных им для императорской Кунсткамеры зверех и птицах», который цитирует Юрьев в отношении земноводных и пресмыкающихся.

Млекопитающие. Три каталога по млекопитающим обнаружены в СПФ АРАН. Самая ранняя опись, составлена Эдуардом Менетрие в 1829 году. Систематический каталог млекопитающих, озаглавленный по-немецки «Verzichniss Von….<Hp36P> zoologisher Museen Kizerlichen Akademien von Wissenshaften fon Jahren 1831» с пронумерованными от № 1 до 334 экземплярами, датируется 15 ноября 1831 года. Среди них есть 117 предметов с пометкой «Кунсткамера». Следующий по времени каталог млекопитающих, озаглавленный «Enumeratio mammalium quae in Museo Zoologico Academiae Imperialis Scientiarum Petropolitanae Anno MDCCCXXXV inveniebantur», представляет собой писанный Ф. Ф. Брандтом каталог млекопитающих, доложенный Конференции 17 июля 1835 года. В нём уже 67 экземпляров помечены словом «Кунсткамера».