Покинув Северо-Восточное Приазовье, Э. Краффорд не остался без дела — Разряд предоставил ему важную роль в реализации более масштабного проекта. Не позднее февраля 1702 года мастера решили задействовать в создании водной системы, известной в историографии под названием Ивановского канала. При помощи каналов и шлюзов Пётр I предполагал соединить верховья Дона с рекой Ша — тью, впадающей в Упу — приток Оки, и тем самым связать волжский и донской речные пути. Прокладка трассы канала в Епи — фанском уезде близ Иван-озера началась в 1701 году, на следующий год было запланировано сооружение каменных шлюзов, которым и должен был руководить гидравлик. Характерно, что в официальных документах, связанных с командировкой Э. Краффорда «к слюзно — му делу», он фигурирует уже как инженер. Из этих же источников известно, что за четыре года пребывания в России голландец так и не овладел русским языком — вместе с ним в поездку в качестве толмача отправился капитан Пётр Юрьевич Дреер. Согласно разнарядке, на строительстве канала в феврале-марте 1702 года у Иван-озера должны были собраться 10 000 человек из двадцати двух городов Центральной России.

К сожалению, мы не располагаем пока данными о конкретной роли Э. Краффорда в сооружении шлюзов Ивановской водной системы. По свидетельству К. де Бруина, к 1703 году у Иван-озера было построено семь шлюзов. Гидростроительство продолжались с 1702 по 1709 год, затем приостановилось, возобновилось в 1717 году, и окончательно прекратилось в 1720 году.